近些年，由于现代科技的高度发展，国际上开展了对贝毒成分的系统研究，检测方法的发展方向必然要依赖于仪器分析。尤其制备贝毒标准物更需要化学手段。仪器分析有可能使毒素的检测研究达到高精确度、高灵敏度和自动分析。
一些学者试图用电泳法、薄层层析、离子交换层析等方法达到分离提纯贝毒的目的。一些学者又采用气相、液相色谱、光谱、质谱和x射线以及核磁共振等先进技术和设备对贝毒成分和结构进行研究 。高效液相色谱技术发展最快，也最为成熟。它具有明显的优越性：（l）灵敏度高；（2）专一性强；（3）在酸性条件下不稳定的基因如氨甲酞基、磺基在分析的过程中不会解离，缩短了分析时间，通过自动注射技术能处理更多的样品。便于进行毒素监控；（4）能够提供关于毒素的更多信息，能够测出每一个组分的具体含量及毒性的大小，从而有助于比较或了解毒素种类的差异。
液相色谱与离子溅射质谱法连用（Lc一Ms），更是一种特别适用于确定毒素及鉴别新毒素的有效方法。液相色谱荧光法其原理是：利用这些毒素含有允许被转化成荧光酷衍生物的梭基，再使用荧光检测器进行液相色谱分析。